Bối cảnh

Câu chuyện được bắt đầu vào năm 3394, một ngàn năm kể từ khi con người chạy trốn khỏi Trái Đất, sau khi nó bị phá hủy bởi những quái vật ngoài hành tinh khổng lồ có khả năng thay đổi hình dạng được gọi là Gauna (奇居子（ガウナ）, Gauna?), trên những chiếc phi thuyền ” tàu hạt mầm ” không gian khổng lồ được tạo ra từ phần còn lại của hành tinh. Một trong số đó là phi thuyền "Sidonia", được phát triển dựa trên chính nền văn hóa của loài người, gần như là văn hóa Nhật Bản, tại đây, việc nhân bản vô tính con người, sinh sản vô tính, công nghệ gene (ví dụ như việc cho phép con người có khả năng quang hợp) trở nên phổ biến. Đồng thời, ở đây, họ cũng đã khám phá ra một trong những bí mật lớn nhất với xã hội loài người, đó là sự bất tử. Với dân số hơn 500.000 người, Sidonia có thể là quần thể cư dân cuối cùng của con người, số phận của những con tàu đều là chưa rõ ràng.

Loài người có hiểu biết rất hạn chế về bản chất thực sự của Gauna cũng như nguyên nhân tại sao chúng lại tấn công con người. Mỗi Gauna có một phần lõi gần như bất khả xâm phạm được bảo vệ bởi một khối lượng lớn vật chất được gọi là "placenta" (胞衣, ena?) - nhau thai, thường được gọi là "Ena". Một khi phần nhau thai bị đánh bay và phần nhân bị phá hủy, toàn bộ phần thân của Gauna sẽ bị phân rã.[2]

Sidonia được bảo vệ bởi loại vũ khí cơ giới cỡ lớn được gọi Vệ nhân (衛人, Morito?) với vũ khí chính và năng lượng hoạt động được cung cấp bởi "Hạt Heigus" (ヘイグス粒子, Heigusu Ryūshi?),[3] trang bị một khẩu pháo hạng nặng cho các cuộc tấn công tầm xa và một cây giáo đặc biệt được gọi là "Kabizashi" cho cận chiến. Mũi của kabizashi được làm bằng một loại vật liệu đặc biệt khó kết nối nhưng sở hữu khả năng đặc biệt là hủy diệt hoàn toàn phần lõi của Gauna. Sau này, Vệ nhân còn được trang bị thêm vũ khí tầm xa với đạn làm từ loại vật liệu tương tự như Kabizashi - được con người tìm ra và bắt đầu sản xuất với số lượng lớn. Hầu hết mọi người trong cộng đồng người sống sót đều được kiểm tra và đề cử làm phi công của Vệ nhân ở độ tuổi trẻ, nếu họ có khả năng vận hành chúng.

Cốt truyện

Câu chuyện xoay quanh nhân vật Nagate Tanikaze, người đã sống dưới tầng ngầm của Sidonia kể từ khi sinh ra và được nuôi dạy bởi ông của anh. Chưa bao giờ gặp bất cứ ai khác, anh tự rèn luyện trong một bộ giả lập đào tạo phi công cũ mỗi ngày, cuối cùng làm chủ nó. Sau cái chết của người ông, anh đã tiến lên bề mặt và được lựa chọn là một phi công Vệ nhân, khi mà Sidonia một lần nữa đối mặt với Gauna.